Microbioma oral: variabilidad entre regiones y poblaciones / Oral Microbiome: Variability Between Regions and Populations

Resumen De acuerdo con la Organización Mundial de la Salud (OMS), 3.58 billones de personas son afectadas por desórdenes orales, donde la caries, seguida de la enfermedad periodontal son las más frecuentes y las principales causas de daño al tejido pulpar y pérdida de órganos dentales. En México, el Sistema de Vigilancia Epidemiológica de Patologías Bucales (SIVEPAB) reportó que el 53% de la población se ve afectada por algún grado de enfermedad periodontal, mientras que en promedio la caries afecta al 93.3% de la población de entre 20 a 85 años y más, así como a alrededor del 50.0% de niños y adolescentes, por lo que ambos padecimientos son considerados un problema de salud pública importante en este país. Adicionalmente, se sabe que el microbioma oral humano está asociado con la salud y la enfermedad bucodental. Entre los géneros bacterianos que comúnmente habitan la cavidad oral humana destacan Streptococcus spp., Lactobacillus spp. y Porphyromonas spp. que, a través del desequilibrio del microbioma oral (disbiosis), se asocian con la caries o la enfermedad periodontal. En vista de que estamos constantemente expuestos a este tipo de infecciones crónicas inflamatorias, se sabe que las bacterias orales se trasladan a otras partes del cuerpo contribuyendo al desarrollo y exacerbación de la inflamación sistémica y otras enfermedades. Ya que existen factores como la ubicación geográfica, además de la disbiosis, la edad, la dieta y la genética, que influyen en la variabilidad del microbioma humano. Es importante analizar la diversidad del microbioma oral desde esta perspectiva, ya que el conocimiento que se tiene hasta el momento aún es escaso; por lo anterior se realizó una búsqueda de artículos publicados entre 2010 y 2020 en poblaciones de Asia, África, América y Europa, con el fin de responder la siguiente pregunta: ¿el factor geográfico tiene un impacto en la composición de la variabilidad del microbioma oral humano?

Abstract According to the World Health Organization (WHO), 3.58 billion people were affected by oral disorders, where caries, followed by periodontal disease are the most frequent and the main causes of damage to pulp tissue and loss of dental organs. In Mexico, the Epidemiological Surveillance System for Oral Pathologies (SIVEPAB) reported that 53% of the population is affected by some degree of periodontal disease, while on average caries affects 93.3% of the population between 20 and 85 years old and older, as well as about 50.0% of children and adolescents, so both conditions are considered an important public health problem in this country. Additionally, the human oral microbiome is known to be associated with oral health and disease. An imbalance in the oral microbiome (dysbiosis) can result in the proliferation of Streptococcus mutans and Porphyromonas gingivalis, linked to caries and periodontal disease. The latter two conditions, the most prevalent oral diseases worldwide, are the main causes of damage to pulp tissue and loss of dental organs. In the presence of these pathologies, constant exposure to the corresponding inflammatory chronic infection could lead to the translocation of oral bacteria to other parts of the body, where they may contribute to the development and/or exacerbation of systemic inflammation and trigger disease. Since age, diet, genetics, and geographical location are known to influence the variability of the human microbiome, it is important to analyze differences in the oral microbiome between distinct populations. Up to now, little attention has been given to this task. The current review carried out for articles published between 2010 and 2020 and describes the human oral microbiome in populations of Asia, Africa, America and Europa, to explore whether geographical differences have an impact on the variability of the human oral microbiome.

Antimicrobial resistance and antibiotic consumption in Mexican hospitals / Resistencia antimicrobiana y consumo de antibióticos en hospitales mexicanos

Abstract: Objective: To establish the current situation of antimicrobial resistance and antibiotic consumption in Mexican hospitals. Materials and methods: Antimicrobial susceptibility data from blood and urine isolates were collected. Defined daily dose (DDD) of antibiotic consumption/100 occupied beds (OBD) was calculated. Results: Study period: 2016 and 2017. Of 4 382 blood isolates, E. coli and K. pneumoniae were most frequently reported, with antimicrobial resistance >30% for most drugs tested, only for carbapenems and amikacin resistance were <20%. A. baumannii had antimicrobial resistance >20% to all drugs. Resistance to oxacillin in S. aureus was 20%. From 12 151 urine isolates, 90% corresponded to E. coli; resistance to ciprofloxacin, cephalosporins and trimethoprim/sulfamethoxazole was >50%, with good susceptibility to nitrofurantoin, amikacin and carbapenems. Global median antimicrobial consumption was 57.2 DDD/100 OB. Conclusions: This report shows a high antimicrobial resistance level in Gram-negative bacilli and provides an insight into the seriousness of the problem of antibiotic consumption.

Resumen: Objetivo: Establecer la situación actual de la resistencia antimicrobiana y el consumo de antibióticos en hospitales mexicanos. Material y métodos:F Se colectaron datos de susceptibilidad antimicrobiana de aislamientos de sangre y orina. Se calculó la dosis diaria definida (DDD) del consumo de antibióticos/100 estancias. Resultados: Periodo de estudio de 2016 a 2017. De 4 382 aislamientos en sangre, E. coli y K. pneumoniae fueron las más frecuentes, con resistencia >30% a la mayoría de las drogas evaluadas; sólo para carbapenémicos y amikacina la resistencia fue <20%. A. baumannii tuvo resistencia >20% a todos los fármacos. La resistencia a oxacilina en S. aureus fue de 20%. De 12 151 aislamientos en urocultivos, 90% correspondió a E. coli; la resistencia a ciprofloxacina, cefalosporinas y trimetoprima/sulfametoxazol fue >50%, con buena susceptibilidad a nitrofurantoína, amikacina y carbapenémicos. La mediana del consumo global de antibióticos en DDD/100 estancias fue de 57.2. Conclusiones: Este reporte muestra el nivel elevado de resistencia en bacilos Gram-negativos y brinda una perspectiva de la gravedad del problema del consumo de antibióticos.

Relevance of Helicobacter pylori virulence factors for vaccine development / Relevancia de los factores de virulencia de helicobacter pylori para el desarrollo de vacunas

Helicobacter pylori infection increases the risk for a wide spectrum of clinical outcomes, ranging from peptic ulcer disease to gastric cancer. However, the infection induces gastric and duodenal ulceration or gastric cancer in only a minority of infected subjects because H. pylori strains are genetically diverse and express different virulence factors. Individuals infected with strains that express these virulence factors probably develop severe diseases such as gastric cancer. Nevertheless, the ancient relationship between H. pylori and humans suggests that some strains could be beneficial to human health, which means that generalized administration of antibiotic therapy could eventually cause problems. The development of vaccines based on virulence factors that provide long-term protection is the best strategy for control and/or elimination of pathogenic strains. The different immunization schemes and formulations designed to evaluate the vaccines based on virulence factors in animal models have offered promising results. However, it is necessary to determine whether or not these results can be reproduced in humans. This article reviews recent vaccination studies that explore this possibility: oral vaccines using urease or inactivated whole cells plus LT as adjuvant and urease expressed in Salmonella spp. vectors, as well as a parenteral multicomponent vaccine plus aluminum hydroxide as adjuvant. Although these studies have achieved limited success, they have established support for the development of an effective vaccine against this infection.

La infección por Helicobacter pylori incrementa el riesgo de un amplio espectro de cuadros clínicos, que van de la úlcera péptica al cáncer gástrico. Sin embargo, la infección sólo induce ulceración gástrica y duodenal o cáncer gástrico en la minoría de los sujetos infectados debido que las cepas de H. pylori son genéticamente diversas y expresan diferentes factores de virulencia. Así, los individuos infectados por cepas que expresan estos factores de virulencia probablemente desarrollan enfermedades severas como el cáncer gástrico. Sin embargo, la ancestral relación entre H. pylori y los humanos sugiere que algunas cepas pueden ser beneficiosas para la salud humana. Por lo tanto, la administración generalizada de tratamientos con antibiótico podría eventualmente causar problemas. El desarrollo de vacunas con base en factores de virulencia que confieran protección a largo plazo es la mejor estrategia para el control y/o eliminación de cepas patógenas. Los diferentes esquemas y formulaciones de inmunización diseñados para evaluar las vacunas con base en factores de virulencia en modelos animales han dado resultados prometedores. Sin embargo, ha sido necesario probar si estos resultados pueden ser reproducidos en humanos. Este trabajo revisa los recientes estudios de vacunación que han explorado esta posibilidad: vacunas orales usando ureasa o células completas-inactivadas con LT como adyuvante y ureasa expresada en vectores de Salmonella spp.; además de una vacuna intramuscular multicomponente con hidróxido de aluminio como adyuvante. Aunque estos estudios han logrado limitado éxito han establecido las bases para el desarrollo de una vacuna eficaz contra esta infección.

Actividad de las fluoroquinolonas en aislamientos clínicos de Streptococcus pneumoniae con diferente susceptibilidad a la penicilina: Estudio epidemiológico en cinco ciudades de la República Mexicana / Flouroquinolone activity in clinical isolates of Streptococcus pneumoniae with different susceptibility to penicilline: An epidemiological study in five cities of Mexico

Objetivo: Determinar el grado de sensibilidad a cinco fluoroquinolonas, y la resistencia cruzada, en aislados clínicos de neumococo con diferente susceptibilidad a la penicilina Diseño: Estudio transversal Lugar: Los aislamientos de Streptococcus pneumoniae (Sp) se obtuvieron en cinco centros de atención médica y en un laboratorio de referencia de cinco ciudades de la República Mexicana, durante febrero de 1999 a mayo del 2000. Material: 231 aislamientos de Sp obtenidos de muestras de secreción de la vía aérea o sangre, de 231 pacientes con infección respiratoria aguda o bacteriemia adquiridas en la comunidad. Mediciones: Se midió la susceptibilidad in vitro a penicilina (PEN), ciprofloxacina (CIP), levofloxacina (LEV), gatifloxacina (GAT), moxifloxacina (MOX) y gemifloxacina (GEM) mediante la determinación de la concentración mínima inhibitoria (CMI) con la prueba E. Resultados: 42% de los aislamientos mostraron susceptibilidad disminuida a la PEN. La mínima concentración del antibiótico que logró inhibir al 90% de los aislamientos fue de 3 µg/ml (para la CIP), 1 Hg/ml (para la LEV), 0.25ng/ml (para la GAT), 0.125 µg/ml (para la MOX) y 0.032 µg/ml (para la GEM). La mediana de la CMI para la LEV (GAT, MOX y GEM) se incrementó proporcionalmente a la disminución de la sensibilidad del neumococo a la CIP. La susceptibilidad a la CIP fue semejante entre los aislamientos sensibles y resistentes a la PEN. Conclusión: las fluoroquinolonas de tercera y cuarta generación mostraron tener buena actividad inhibitoria del neumococo, incluyendo a las cepas resistentes a la PEN, siendo mayor que la de CIP. Se documentó resistencia cruzada entre las fluoroquinolonas.

Objective: Determine the susceptibility to five fluoroquinolones and cross resistance of pneumococcus clinical isolates with different penicillin susceptibilities gathered in a community based study . Design: Cross sectional survey. Materials: Two hundred and thirty one (231) isolates were obtained from respiratory secretions or blood specimensfrom 231 patients with acquired acute respiratory infection or bacteremia. Outcome measures: In vitro susceptibility to penicillin (PEN), ciprofloxacin (CIP), levofloxacin (LEV), gatifloxacin (GAT), moxifloxacin (MOX) and gemifloxacin (GEM) was determined with minimal inhibitory concentration (MIC) using the E test. Results: 42% of the isolates showed decreased susceptibility to PEN. The lowest antibiotic concentration that inhibited 90% of the isolates was 3 Hg/ml (for CIP), 1 µg/ml (forLEV), 0.25 µg/ml (for GAT), 0.125 µg/ml (for MOX) and 0.032 µg/ml (for GEM). Median MIC for LEV, GAT, MOX and GEM increased with decreasing susceptibility to CIP. Susceptibility to CIP was similar between penicillin susceptible and penicillin resistant pneumococci. Conclusion: Third and fourth generation fluoroquinolones showed very high inhibitory activity, higher than that for CIP, for both penicillin susceptible and penicillin resistant pneumococci. We noted cross resistance among fluoroquinolones.

Helicobacter pylori: focus on CagA and VacA major virulence factors: [review] / Helicobacter pylori: enfoque sobre los factores de virulencia CagA y VacA: [revisión]

After colonizing the human gastric mucosa, Helicobacter pylori can remain within the host for years and even decades, and is associated with several, highly significant gastric pathologies. In Mexico, the seroprevalence at 1 year of age is 20 percent and the estimated increment in seropositivity per year is 5 percent for children aged 1-10 years. More than 80 percent of adults are infected by the time they are 18-20 years old. Bacterial virulence factors have been proposed for H. pylori, such as urease, flagella, heat-shock protein, lipopolysaccharide, adhesions, vacuolating cytotoxin, cag pathogenicity island and the cytotoxin-associated protein, the latter being the most studied mechanism to date.

Después de colonizar la mucosa gástrica humana, Helicobacter pylori puede permanecer por años e incluso décadas en el humano, y se asocia a varias patologías gástricas. En México, la seroprevalencia estimada es de 20 por ciento en niños de un año de edad, con una tasa de incremento en seropositividad de 5 por ciento anual durante los primeros 10 años de vida hasta alcanzar 80 por ciento en adultos jóvenes entre los 18 y 20 años de edad. Los factores bacterianos de virulencia propuestos para H. pylori son ureasa, flagelos, proteínas de choque térmico, lipopolisacárido, adhesinas, citotoxina vacuolizante, isla de patogenicidad y la proteína asociada a la citoxina; este último factor es el más estudiado hasta la fecha.

Resistencia a antimicrobianos de helicobacter pylori en un centro de referencia infectológico / Antimicrobial resistance in isolates of Helicobacter pylori in a referral center

Objetivo. Estimar la frecuencia de aislados clínicos de H. pylori resistentes a seis antibióticos de uso común en su erradicación. Diseño. Estudio observacional transversal. Lugar. Institución hospitalaria de referencia de tercer nivel. Participantes. 31 aislamientos de igual número de enfermos con gastritis antral crónica, obtenidos de biopsias de mucosa gástrica. Desenlace principal. Se midió la concentración mínima anhibitoria (CMI) de metronidazol, tetraciclina, doxiciclina, ampicilina, amoxicilina y de subcitrato de bismuto mediante la técnia de dilución en placas de agar. Resultados. Todos los aislados mostraron ser sensibles a tetraciclina, doxiciclina, ampicilina y a amoxicilina; sólo 46 por ciento y 55 por ciento fueron inhibidos a concentraciones menores a 8 µg/mL y a 16 µg/mL de metronidazol, respectivamente. Todos los aislamientos fueron inhibidos a una concentración =128 µg/mL de la sal de bismuto. Se observó un incremento del 50 por ciento en el porcentaje de aislados resistentes a metronidazol (resistencia definida como una CMI = 8µg/mL) al comparar los de 1988 con los de 1992. Conclusión. Se necesitan estudios a futuro que evalúen cuál esquema de antibioticoterapia ofrece un mejor índice costo/beneficio en el tratamiento de la úlcera péptica por H. pylori en nuestro medio

Epítopos continuos y comunes presentes en las fimbrinas de Escherichia coli enterotoxigénica (ETEC) / Common continuos epitopes present in enterotoxigenic escherichia coli (ETEC) fimbriae

Escherichia coli enterotoxigénica (ETEC) es un agente causal de diarrea. ETEC cuenta con factores antigénicos de colonización (CFAs y PCFs), que son importantes en la virulencia. Los anticuerpos contra los CFAs son producidos al término de la infección por ETEC y han mostrado ser protectores contra la enfermedad. Sin embargo, los epítopos en CFA/I, los cuales inducen protección, no han sido caracterizados. El objetivo de este estudio es la detección de los epítopos continuos y comunes en CFA/I de ETEC, a nivel molecular, que conduzcan al desarrollo de métodos para la prevención de la enfermedad causada por ETEC. Se sintetizaron octapéptidos continuos unidos a fase sólida que comprendían a todo la secuencia de CFA/I por el método de Geysen para el escrutinio, con sueros de niños infectados por ETEC, con sueros de adultos de zona endémica y no endémica con el anticuerpo monoclonal CAF/I 1:6 (Mab CFA/I 1:6) y con los sueros hiperinmunes contra CFAs y PCFs diferentes a CFA/I. Los sueros de los niños, de los adultos de zona endémica y los sueros hiperinmunes reconocieron tres epítopos continuos y comunes en CFA/I. El Mab CFA/I 1:6 no reconoció nungún epítopo continuo

Desarrollo de un nuevo modelo animal experimental hámster sirio dorado para el estudio de la inffección por Escherichia coli enterotoxigénica (ETEC) / Development of a new experimental aniaml model Sirian golden hamster for the study of enterotoxigenic Escherichia coli infection

Existen diversos modelos animales para el estudio de la patogenicidad, virulencia e inmunidad. Sin embargo, carecen de fidelidad y facilidad en su manejo por requerir manipulación quirúrgica, lo que limita de forma importante su uso para estudios de inmunidad y protección. El hámster sirio dorado (HSD) (M. auratus) tan sólo procede de tres líneas capturadas en Aleppo, Siria, y existe la posibilidad de que los genes de histocompatibilidad sean reflejo del número de genes de la línea original. Es conocido que las colonias de hámsters se mantienen cerradas en condiciones higiénicas, y su equivalencia es la libre de patógenos específicos en la rata. Este trabajo postula, y valida un nuevo modelo animal HSD para el estudio de la infección por Escherichia coli enterotoxigénica (ETEC). Se tomó a cuatro grupos de seis HDS divididos por edad en semanas y se infectó oralmente a cada grupo con un inóculo de ETEC de 2 x 10 a la 8 bacterias por mililitros. Se mantuvieron los HSD con agua ad libitum antes y durante la infección. Los parámetros evaluados fueron: presencia, duración y gravedad de la diarrea, así como el número de días y el porcentaje de ETEC excretada. Los resultados se analizaron por la prueba de distribución de chi cuadrada. Todos los grupos de HSD mostraron alta susceptibilidad a la infección por ETEC. Particularmente, el grupo de siete semanas mostró un 100 por ciento de presencia de diarrea, en comparación con 50 por ciento, 16 por ciento y 0 por ciento en los grupos de 10, 11 y13, respectivamante. La duración y la gravedad de la diarrea fue tres veces mayor en el grupo de siete semanas al ser comparado con los otros grupos. Los días promedio de excreción en el grupo de siete semanas fueron 5.7 contra 2.4, 2 y 0.5 días, respectivamante; el análisis de chi cuadrada de las variables mencionadas mostró una p< 0.0001. El modelo del HSD de siete semanas resultó ser fácilmente manipulable, reproducible, de bajo costo, y, por lo tanto, altamnte eficiente para el estudio de la infección experimental por ETEC